Estados Unidos conquistou o quadro geral de medalhas da natação olímpica em Tóquio somando 11 medalhas de ouro, dez de prata e nove de bronze, total de 30 medalhas. Comparando com a campanha do Rio-2016, os americanos venceram 33 medalhas e 16 de ouro. A campanha de Tóquio dos americanos é inferior a todas as Olimpíadas desde Barcelona 1992.
A Austrália ficou em segundo lugar alcançando sua melhor campanha da história somando 20 medalhas sendo nove de ouro, três de prata e oito de bronze. A melhor campanha anterior era dos Jogos de Melbourne em 1956 com oito medalhas de ouro. Uma melhora incrível dos australianos em relação a última Olimpíada onde foram apenas seis medalhas e três de ouro.
Grã-Bretanha chegou em terceiro com oito medalhas sendo quatro ouros, três pratas e um bronze. Foi recorde de total de medalhas superando as sete dos Jogos de 1908 e também de ouros. O Brasil com as duas medalhas de bronze terminou em 17º lugar.
Um total de 21 países somou medalhas na competição, mesmo total da última Olimpíada sendo que dez países ganharam pelo menos uma medalha de ouro.
Veja abaixo o quadro final de medalhas